Organe upravljanja Univerziteta Mediteran Podgorica čine: Skupština osnivača, Upravni odbor i Predsjednik Univerziteta.

Skupštinu osnivača čini sljedeća pravna lica i pojedinci:

• Atlas Invest d.o.o. Podgorica
• Jadranski sajam a.d. Budva
• Atlas banka a.d. Podgorica
• DZU Investicionim fondom Atlas mont a.d. Podgorica
• Prof.dr Stevan Popović

Upravni odbor Univerziteta Mediteran Podgorica čine:

• prof. dr Janko Radulović, predsjednik osnivača
• prof.dr Marija Janković, predstavnica osnivača
• dr Meliha Ramusović, predstavnica osnivača
• Marko Nikolić, predstavnik osnivača
• Branislav Krtinić, predstavnik osnivača
• Ljiljana Ćetković, predstavnica osnivača
• Filip Žugić, predstavnik studenata

Predsjednik Univerziteta Mediteran Podgorica je dr Duško Knežević,
koga zastupa Opunomoćeni zastupnik predsjednika, Prof.dr Nebojša Šarkić.

Organi rukovođenja Univerziteta Mediteran Podgorica su: Rektorat (Rektor, Prorektori, Generalni sekretar), Rektorski kolegijum (u užem i širem sastavu), Izvršni direktor i Stručne službe.

Najviši organ administrativnog i akademskog rukovođenja je rektor, čiju funkciju obnaša Prof.dr Savo Marković, doktor pravnih nauka.

U dijelu nadležnosti Rektoru pomažu dva prorektora, i to:

• Prorektor za nastavu, prof.dr Darko Lacmanović, doktor ekonomskih nauka
• Prorektor za međunarodnu saradnju, prof.dr Marija Janković, doktor ekonomskih nauka

Rektorat čini i Generalni sekretar, čiju funkciju obavlja Marina Peruško.

Rektorski kolegijum je organ rukovođenja, koji se sastaje u užem i širem sastavu. Pored rektora, prorektora i generalnog sekretara, kolegijum u užem sastavu čine i dekani svih fakulteta Univerziteta. Rektorski kolegijum u širem sastavu pored navedenih članova užeg sastava čine i prodekani svih organizacionih jedinica. Aktuelni saziv rektorskog kolegijuma u širem sastavu glasi:

U akademska tijela Univerziteta Mediteran Podgorica spadaju: Senat, Etički i Uređivački odbor.

Najviše akademsko tijelo Univerziteta Meditaran Podgorica je Senat. Aktuelni sastav Senata čine članovi:

• Prof. dr Duško Knežević
• Prof. dr Savo Marković
• Prof. dr Radislav Jovović
• Prof. dr Dejan Erić
• Prof. dr Nebojša Šarkić
• Prof. dr Zoran Grubišić
• Prof. dr Radmila Janičić
• predstavnik studenata – Vera Ujkić
• predstavnik studenata – Milena Matanović

Aktuelni sastav etičkog odbora čine članovi:

• prof.dr Velizar Sredanović, predsjednik, vanredni profesor na Fakultetu za ekonomiju i biznis
• prof.dr Darko Lacmanović, član, redovni profesor Fakulteta za turizam “Montenegro Tourism School”
• doc.dr Žana Knežević, član, docentkinja na Fakultetu za informacione tehnologije
• prof.mr Marija Džoganović, član, vanredna profesorka na Fakultetu vizuelnih umjetnosti
• doc. dr Vesna Tripković Samardžić, član, docentkinja na Fakultetu za strane jezike
• doc. dr Minja Simović, član, docentkinja na Pravnom fakultetu,
• Sunčica Ilić, član, studentkinja osnovnih studija Fakulteta za ekonomiju i biznis
• Maja Boljević, član, studentkinja master studija Fakulteta za ekonomiju i biznis
• mr Klara Đurović, član, studentkinja doktorskih studija Fakulteta za ekonomiju i biznis

Aktuelni sastav uređivačkog odbora čine članovi:

• Jelena Šukić, sekretarka
• prof.dr Olena Lilova, za strane jezike (predsjednica)
• prof.dr Snežana Šćepanović, za tehničke i informatičke nauke
• prof.dr Darko Lacmanović, za turizam i hotelijerstvo
• dr Zarija Pejović, za društveno humanističke i pravno ekonomske nauke
• prof.mr Marija Džoganović, za umjetnost